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芬蘭科學家利用轉錄組測序揭示前列腺癌中重要調控因子
2015/8/29 14:55:21 瀏覽次數:177

芬蘭科學家利用轉錄組測序揭示前列腺癌中重要調控因子

 
   近日,芬蘭坦佩雷理工大學科學家Antti Ylipää等利用高通量測序技術對前列腺癌患者進行轉錄組測序,發現前列腺癌中的重要調控lncRNA——PCAT5,PCAT5可作為去勢難治性前列腺癌(CRPC)的生物分子標記。文章于2015年8月17日發表在Cancer Research(影響因子9.329)雜志上。

前列腺癌是男性常見惡性腫瘤,在某些國家和地區發病率高于肺癌等居首位,并呈逐年上升的趨勢。對于前列腺癌患者在診斷時大多已發展到中晚期,雖然通過內分泌治療可以使病情得到緩解,但多數前列腺癌患者會發展成去勢難治性前列腺癌,去勢難治性前列腺癌患者預后極差。去勢難治性前列腺癌是國際醫學界面臨的科學難題,缺乏有效的治療手段。

Antti Ylipää等通過高通量測序手段,利用Illumina公司HiSeq 2000測序平臺對12個良性前列腺增生(BPHs)患者樣本、28個未經治療的前列腺癌(PCs)患者樣本和13個去勢難治性前列腺癌(CRPCs)患者樣本進行轉錄組測序。本研究新發現145個未經注釋的lncRNA或同源異構體(isoform)序列,其中三分之一的序列為CRPCs特有。

作者發現PCAT5為特異性的lncRNA,僅存在于靶標轉錄因子ERG-positive前列腺癌患者樣本和去勢難治性前列腺癌患者樣本中,PCAT5作為新發現的致瘤lncRNA,調節靶標轉錄因子,并參與細胞的生長、遷移和細胞凋亡等。

此外,利用聚類分析和主成分分析等方法揭示不同樣本之間關鍵通路的基因表達量變化;對前列腺癌樣本和去勢難治性前列腺癌樣本中新發現的差異表達lncRNA的表達量進行檢測;抑制PCAT5的表達會導致ERG-positive前列腺癌細胞的生長、遷移能力的降低。

本文通過轉錄組測序為去勢難治性前列腺癌提供生物分子標記,對臨床治療具有重要的指導意義

原文索引:

http://cancerres.aacrjournals.org/content/early/2015/08/15/0008-5472.CAN-15-0217.full.pdf+html?sid=03a5406c-8876-4535-b0f3-09a219dfc537

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